构建一个属性平衡且专精的阵容至关重要。二周目的敌方训练家等级会显著提升，阵容也更加多样化，因此需要选择能够覆盖多种属性的宝可梦。推荐的核心阵容应包括喷火龙、水箭龟、雷丘、胡地和暴鲤龙，这些宝可梦在各自擅长的领域都能发挥出色表现。喷火龙作为火/飞行双属性，能有效对抗草、虫和冰系；水箭龟则提供稳定的水系输出和防御；雷丘凭借高速和电系技能先发制人；胡地拥有顶级特攻和精神冲击等强力技能；暴鲤龙的水/飞行属性则能应对多种战斗场景。
属性克制是二周目阵容构建的首要考量因素。队伍中应尽可能涵盖火、水、电、超能、飞行等主要攻击属性，同时也要注意防御属性的互补性。比如钢系的大钢蛇能提供出色的防御能力，抵抗多种属性攻击；而格斗系的火爆猴则能针对冰系和岩石系敌人。特殊情况下还需要考虑针对神兽战的配置，比如携带急冻光线应对闪电鸟，或准备地面系技能对抗雷系宝可梦。每个宝可梦都应专注于其最擅长的领域，物攻手和特攻手要合理搭配，避免属性重复或短板过于明显。
技能搭配方面需要注重实用性和覆盖面。主力输出宝可梦应配备本系高威力技能，如喷火龙的火焰喷射、水箭龟的水炮等。辅助型技能如催眠粉、电磁波等控场技能也很有价值，特别是在捕捉野生宝可梦或应对强力对手时。交通工具技能如冲浪、碎岩等可以交给特定宝可梦学习，但要注意不要过度牺牲战斗力。每个技能位都应经过慎重考虑，确保在大多数战斗情况下都能发挥作用，避免出现技能盲区。
针对二周目新增的七岛剧情和神兽战，阵容需要额外调整。火焰鸟、急冻鸟和闪电鸟这三只传说宝可梦都值得收服并培养，它们不仅能丰富队伍属性构成，其高种族值也能显著提升整体战力。超梦作为游戏中最强宝可梦之一，在后期战斗中能发挥决定性作用。在挑战训练师塔和火箭队仓库等特殊场景时，可能需要临时调整阵容配置，携带更多回复类道具或针对性技能机器。
最终成型的通关阵容应该在保持核心成员稳定的基础上保留一定灵活性。主力队伍建议维持在4-5只高等级宝可梦，留出1-2个位置根据当前挑战内容进行调整。所有成员等级应均衡发展，避免出现单一高等级宝可梦带队的情况。通过合理搭配属性、技能和战术，这套阵容能够应对二周目绝大多数挑战，包括四天王的重赛和七岛的各种特殊战斗。
